婴幼儿胸腔外科
由于婴幼儿个体小，麻醉和手术难度大，围手术期管理难度大的特殊性。故开展婴幼儿胸腔外科手术风险大，难度高。科室曾对刚出生3天的先天性短食管患儿施行手术治疗，成功地挽救了患儿的生命。至目前科室收治逾百例婴幼儿巨大纵隔肿瘤患儿。手术成功率高，在国内处于领先水平。
肝脏外科
肝脏外科主要开展肝脏良恶性肿瘤的诊断和治疗，以及对终末期肝病的患者进行肝移植手术。收治各类肝脏占位性疾病，年收治病人余例，每月手术量约余台。作为医教研一体的专科，我们在各种复杂肝脏占位性疾病的诊治及相关研究方面均达国内先进水平。肝脏外科正以精湛的技术、优良的服务，认真的教学，严谨的科研稳步前进。
肺外科
不仅开展常规的肺大疱切除术、肺叶切除术、肺癌根治术，尤其擅长支气管袖状肺叶切除术，气管隆突切除成形术，支气管肺动脉双袖切术，局部晚期肺癌扩大根治术(侵及大血管、心房，胸壁，气管)，肺减容术等复杂高难度手术，已治疗肺癌患者超过余例，手术成功率高，并发症少，效果满意。
气管外科
气管肿瘤和瘢痕性狭窄是常见的气管疾病，气管切除重建手术代表了胸外科的技术水平和综合实力，科室气管切除长度达6cm，这是气管切除的极限。科室成功进行了气管肿瘤切除重建后肿瘤复发二次切除重建手术，成功地完成了双源性气管肿瘤切除重建手术。现已治疗气管肿瘤和狭窄患者逾百例，手术成功率达97.4%。在国内处于领先水平。
食管外科
隧道式食管胃吻合术：学科刘锟教授经过长期的临床实践创立的“隧道式”食管胃吻合术治疗食管癌。治疗食管癌病例超过例，使食管癌术后最严重的并发症吻合口瘘发生率降至世界最低水平0.9%，而且具有抗反流的功能，使病人术后生活质量明显优于其它方法。此术式被国内外多种胸外科专著收录，现已推广至全国23个省市。
同时科室开展的结肠代食管术、空肠代食管术、高位食管癌的治疗均处于国内领先水平。